È questo un aspetto da pochi conosciuto. Molti funghi micorrizici infatti sono molto esigenti in fatto di suoli; esempi eclatanti sono il pregiato tartufo bianco (Tuber magnatum) che cresce esclusivamente su suoli calcarei, poco evoluti, relativamente umidi per molta parte dell’anno e alcuni porcini (i Boletus edulis e pinophilus) che crescono viceversa su suoli acidi ed evoluti. Molte altre specie assai conosciute hanno anch’esse esigenze particolari: l’Amanita muscaria, ad esempio, cresce su suoli acidi e, per questo, se la si incontra è presumibile che nell’area anche i porcini siano presenti. Al contrario molte altre specie sono assolutamente indifferenti al suolo. È comunque certo che su questo argomento non tutto è conosciuto e le attuali ricerche vanno proprio nel senso di trovare e definire un maggior legame tra fungo, pianta simbionte, suolo e clima.